Né à Paris, le 24 février 1848.
Fils du poète Arsène Houssaye, l'auteur de l'Histoire du 41e fauteuil ; il fut décoré pour faits de guerre en 1870. Collaborateur de la Revue des Deux Mondes, du Journal des Débats et de plusieurs autres journaux ou revues, il s'est occupé d'histoire et surtout de l'histoire et de l'art grecs. Il a été président de la Société des gens de lettres en 1896 et en 1897.
Élu à l'Académie française le 6 décembre 1894 en remplacement de Charles Lecomte de Lisle, Henry Houssaye a été reçu le 12 décembre 1895 par Ferdinand Brunetière.
Mort le 23 septembre 1911.