1968
Le Système de Leibniz et ses modèles mathématiques
- 2 vol. (PUF)
1969
Hermès I. La communication
1972
Hermès II. L’interférence
1974
Hermès III. La traduction
1974
Jouvences. Sur Jules Verne
1975
Feux et signaux de brume. Zola
(Grasset)
1975
Auguste Comte. Leçons de philosophie positive
- tome I (Hermann)
1975
Esthétiques. Sur Carpaccio
(Hermann)
1977
Hermès IV. La distribution
1977
La Naissance de la physique dans le texte de Lucrèce. Fleuves et turbulences
1980
Hermès V. Le passage du Nord-Ouest
1980
Le Parasite
(Grasset)
1982
Genèse
(Grasset)
1983
Détachement
(Flammarion)
1983
Rome. Le livre des fondations
(Grasset)
1985
Les Cinq Sens
- prix Médicis de l’Essai (Grasset)
1987
L’Hermaphrodite. Sarrasine sculpteur
(Flammarion)
1987
Statues
(François Bourin)
1989
Éléments d’histoire des sciences
- en collaboration (Bordas)
1990
Le Contrat naturel
- prix Blaise Pascal (François Bourin)
1991
Le Tiers-Instruit
(François Bourin)
1992
Éclaircissements
(François Bourin)
1993
Les Origines de la géométrie
(Flammarion)
1993
La Légende des Anges
(Flammarion)
1994
Atlas
(Julliard)
1995
Éloge de la philosophie en langue française
(Fayard)
1997
Nouvelles du monde
(Flammarion)
1997
À visage différent
- collectif (Hermann)
1997
Le Trésor. Dictionnaire des sciences
- collectif (Flammarion)
1998
Paysages des sciences
(Le Pommier)
1999
Variations sur le corps
(Le Pommier)
2000
Hergé mon ami
(Moulinsart)
2001
Hominescence
(Le Pommier)
2001
Le Livre de la médecine
- collectif (Le Pommier)
2002
En amour, sommes-nous des bêtes ?
(Le Pommier)
2002
Jules Verne : la science
(Le Pommier)
2002
L’Homme contemporain
(Le Pommier)
2003
Qu’est-ce que l’humain ?
- collectif (Le Pommier)
2003
L’Incandescent
(Le Pommier)
2004
Rameaux
(Le Pommier)
2006
Récits d’Humanisme
(Le Pommier)
2006
L’art des ponts : homo pontifex
(Le Pommier)
2006
Petites Chroniques du dimanche soir
(Le Pommier)
2007
Carpaccio, les esclaves libérés
(Le Pommier)
2007
Le mal propre
(Le Pommier)
2007
Petites Chroniques du Dimanche soir
- tome II (Le Pommier)
2008
La guerre mondiale
- édition de poche 2011 (Le Pommier)
2009
Écrivains, savants et philosophes font le tour du monde
(Le Pommier)
2009
Petites Chroniques du dimanche soir
- tome III (Le Pommier)
2010
Cahier de L’Herne
(L'Herne)
2010
Temps des crises
(Le Pommier)
2010
Biogée
(Le Pommier)
2011
Habiter
(Le Pommier)
2011
Musique
(Le Pommier)
2012
Andromaque, veuve noire
(L'Herne)
2012
Petite Poucette
(Le Pommier)
2012
Quoi de neuf chez les cathos ?
- Catholicisme et Vatican II : l’avenir
2013
L'art des ponts : homo pontifex
(Le Pommier)
2013
Variations sur le corps
(Le Pommier)
2013
Petite Chroniques du dimanche soir
- Tome V (Le Pommier)
2013
Jules Verne aujourd'hui
- Conversations avec Jean-Paul Dekiss (Le Pommier)
2014
Yeux
(Le Pommier)
2014
Les cinq sens
2014
Le Parasite
2014
Petites Chroniques du dimanche soir
- Tome VI (Le Pommier)
2014
Pantopie, de Hermès à Petite Poucette
(Le Pommier)
2015
Du bonheur, aujourd’hui
(Le Pommier)
2015
De l'impertinence, aujourd'hui
(Le Pommier)
2015
Le Gaucher boiteux
(Le Pommier)
2015
Solitude : dialogue sur l'engagement
(Le Pommier)
2015
Écrivains, savants et philosophes font le tour du monde
(Le Pommier)
2016
Darwin, Bonaparte et le Samaritain
- une philosophie de l'histoire (Le Pommier)
2016
La légende des anges : Hermès, Gabriel, Türing
(Le Pommier)
2017
C'était mieux avant !
(Le Pommier)
2018
Défense et illustration de la langue française aujourd'hui
(Le Pommier)
2019
Morales espiègles
(Le Pommier)